La Sierra de Zongolica cuenta con una gran variedad de animales silvestres en sus diferentes municipios, como por ejemplo: el temazate, el conejo, el tejón, el mapache, la ardilla, el zorro, el tlacuache, entre otros, y en cuanto a aves encontramos águilas, gavilanes, zopilotes, diferentes clases de pájaros y una gran variedad de insectos.
Algunos de los animales que se encuentran en peligro de extinción dentro de la sierra por la caza clandestina y la tala inmoderada de árboles son: el temazate, el tepescuintle y el mapache.